Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms