Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms