Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PSME1Q06323 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms