Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
XPCQ01831 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
XPCQ01831 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
XPCQ01831 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
XPCQ01831 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
XPCQ01831 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
XPCQ01831 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPCQ01831 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPCQ01831 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPCQ01831 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPCQ01831 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPCQ01831 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPCQ01831 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPCQ01831 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPCQ01831 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPCQ01831 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPCQ01831 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPCQ01831 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPCQ01831 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPCQ01831 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPCQ01831 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPCQ01831 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPCQ01831 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPCQ01831 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
XPCQ01831 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPCQ01831 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPCQ01831 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPCQ01831 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPCQ01831 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPCQ01831 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPCQ01831 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
XPCQ01831 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
XPCQ01831 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
XPCQ01831 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
XPCQ01831 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
XPCQ01831 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
XPCQ01831 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
XPCQ01831 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
XPCQ01831 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
XPCQ01831 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
XPCQ01831 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
XPCQ01831 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
XPCQ01831 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
XPCQ01831 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
XPCQ01831 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPCQ01831 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPCQ01831 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPCQ01831 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPCQ01831 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPCQ01831 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPCQ01831 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPCQ01831 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPCQ01831 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPCQ01831 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPCQ01831 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPCQ01831 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPCQ01831 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPCQ01831 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
XPCQ01831 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
XPCQ01831 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPCQ01831 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPCQ01831 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPCQ01831 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
XPCQ01831 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
XPCQ01831 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
XPCQ01831 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
XPCQ01831 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
XPCQ01831 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
XPCQ01831 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
XPCQ01831 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
XPCQ01831 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
XPCQ01831 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
XPCQ01831 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
XPCQ01831 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
XPCQ01831 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
XPCQ01831 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
XPCQ01831 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
XPCQ01831 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
XPCQ01831 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
XPCQ01831 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
XPCQ01831 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
XPCQ01831 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
XPCQ01831 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
XPCQ01831 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
XPCQ01831 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
XPCQ01831 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
XPCQ01831 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
XPCQ01831 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
XPCQ01831 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
XPCQ01831 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
XPCQ01831 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPCQ01831 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPCQ01831 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPCQ01831 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPCQ01831 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPCQ01831 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPCQ01831 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPCQ01831 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPCQ01831 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPCQ01831 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms