Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms