Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms