Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF6P62330 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF6P62330 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF6P62330 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF6P62330 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF6P62330 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF6P62330 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF6P62330 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF6P62330 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF6P62330 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF6P62330 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF6P62330 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF6P62330 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF6P62330 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF6P62330 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF6P62330 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF6P62330 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF6P62330 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF6P62330 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF6P62330 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF6P62330 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF6P62330 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF6P62330 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF6P62330 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF6P62330 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF6P62330 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF6P62330 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF6P62330 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF6P62330 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF6P62330 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF6P62330 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF6P62330 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF6P62330 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF6P62330 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF6P62330 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF6P62330 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF6P62330 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF6P62330 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF6P62330 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF6P62330 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF6P62330 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF6P62330 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF6P62330 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF6P62330 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF6P62330 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF6P62330 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF6P62330 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF6P62330 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF6P62330 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF6P62330 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF6P62330 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF6P62330 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF6P62330 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF6P62330 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF6P62330 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF6P62330 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF6P62330 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF6P62330 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF6P62330 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF6P62330 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF6P62330 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF6P62330 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF6P62330 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF6P62330 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF6P62330 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF6P62330 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF6P62330 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF6P62330 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF6P62330 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF6P62330 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF6P62330 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF6P62330 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF6P62330 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF6P62330 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF6P62330 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF6P62330 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF6P62330 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF6P62330 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF6P62330 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF6P62330 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF6P62330 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF6P62330 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF6P62330 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF6P62330 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF6P62330 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF6P62330 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF6P62330 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF6P62330 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF6P62330 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF6P62330 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF6P62330 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF6P62330 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF6P62330 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF6P62330 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF6P62330 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF6P62330 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF6P62330 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF6P62330 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF6P62330 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF6P62330 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms