Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms