Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NESP48681 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NESP48681 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NESP48681 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NESP48681 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NESP48681 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NESP48681 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NESP48681 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NESP48681 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NESP48681 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NESP48681 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NESP48681 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NESP48681 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NESP48681 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
NESP48681 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NESP48681 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
NESP48681 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NESP48681 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NESP48681 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NESP48681 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NESP48681 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NESP48681 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
NESP48681 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NESP48681 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NESP48681 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
NESP48681 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NESP48681 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
NESP48681 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NESP48681 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NESP48681 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NESP48681 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NESP48681 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NESP48681 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NESP48681 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NESP48681 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
NESP48681 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NESP48681 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NESP48681 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NESP48681 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NESP48681 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NESP48681 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NESP48681 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NESP48681 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NESP48681 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
NESP48681 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NESP48681 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NESP48681 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NESP48681 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NESP48681 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NESP48681 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NESP48681 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NESP48681 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NESP48681 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NESP48681 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NESP48681 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NESP48681 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NESP48681 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NESP48681 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NESP48681 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NESP48681 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NESP48681 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NESP48681 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NESP48681 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NESP48681 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NESP48681 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NESP48681 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
NESP48681 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
NESP48681 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NESP48681 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NESP48681 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NESP48681 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NESP48681 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NESP48681 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NESP48681 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
NESP48681 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NESP48681 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NESP48681 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NESP48681 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NESP48681 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
NESP48681 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NESP48681 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NESP48681 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NESP48681 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NESP48681 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NESP48681 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NESP48681 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NESP48681 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NESP48681 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NESP48681 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NESP48681 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NESP48681 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NESP48681 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NESP48681 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NESP48681 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NESP48681 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NESP48681 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NESP48681 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NESP48681 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NESP48681 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NESP48681 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms