Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DCCP43146 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DCCP43146 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DCCP43146 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DCCP43146 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DCCP43146 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DCCP43146 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DCCP43146 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DCCP43146 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DCCP43146 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DCCP43146 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DCCP43146 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DCCP43146 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DCCP43146 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DCCP43146 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DCCP43146 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DCCP43146 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DCCP43146 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DCCP43146 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DCCP43146 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DCCP43146 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DCCP43146 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DCCP43146 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DCCP43146 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DCCP43146 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DCCP43146 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DCCP43146 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DCCP43146 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DCCP43146 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DCCP43146 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DCCP43146 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DCCP43146 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DCCP43146 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DCCP43146 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DCCP43146 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DCCP43146 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DCCP43146 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DCCP43146 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DCCP43146 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DCCP43146 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
DCCP43146 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
DCCP43146 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DCCP43146 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DCCP43146 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DCCP43146 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DCCP43146 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DCCP43146 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DCCP43146 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DCCP43146 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DCCP43146 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DCCP43146 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DCCP43146 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DCCP43146 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DCCP43146 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DCCP43146 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DCCP43146 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DCCP43146 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DCCP43146 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DCCP43146 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DCCP43146 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DCCP43146 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DCCP43146 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DCCP43146 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DCCP43146 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DCCP43146 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DCCP43146 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DCCP43146 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DCCP43146 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DCCP43146 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DCCP43146 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DCCP43146 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DCCP43146 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DCCP43146 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DCCP43146 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DCCP43146 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DCCP43146 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DCCP43146 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
DCCP43146 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DCCP43146 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DCCP43146 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DCCP43146 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DCCP43146 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DCCP43146 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DCCP43146 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
DCCP43146 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
DCCP43146 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DCCP43146 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DCCP43146 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DCCP43146 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DCCP43146 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DCCP43146 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DCCP43146 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DCCP43146 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DCCP43146 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DCCP43146 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DCCP43146 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DCCP43146 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DCCP43146 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DCCP43146 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DCCP43146 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms