Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCAMP43121 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCAMP43121 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCAMP43121 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCAMP43121 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCAMP43121 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCAMP43121 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCAMP43121 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCAMP43121 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCAMP43121 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCAMP43121 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MCAMP43121 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCAMP43121 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCAMP43121 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MCAMP43121 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCAMP43121 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MCAMP43121 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCAMP43121 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCAMP43121 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCAMP43121 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCAMP43121 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCAMP43121 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCAMP43121 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCAMP43121 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCAMP43121 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCAMP43121 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCAMP43121 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCAMP43121 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCAMP43121 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCAMP43121 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCAMP43121 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MCAMP43121 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCAMP43121 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCAMP43121 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCAMP43121 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCAMP43121 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCAMP43121 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCAMP43121 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCAMP43121 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCAMP43121 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCAMP43121 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCAMP43121 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCAMP43121 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCAMP43121 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCAMP43121 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCAMP43121 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCAMP43121 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCAMP43121 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCAMP43121 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCAMP43121 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCAMP43121 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCAMP43121 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCAMP43121 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MCAMP43121 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MCAMP43121 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCAMP43121 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCAMP43121 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCAMP43121 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCAMP43121 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCAMP43121 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCAMP43121 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCAMP43121 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCAMP43121 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCAMP43121 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCAMP43121 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCAMP43121 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCAMP43121 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCAMP43121 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MCAMP43121 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCAMP43121 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCAMP43121 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCAMP43121 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCAMP43121 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCAMP43121 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCAMP43121 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MCAMP43121 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCAMP43121 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCAMP43121 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCAMP43121 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCAMP43121 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCAMP43121 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MCAMP43121 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
MCAMP43121 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCAMP43121 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCAMP43121 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCAMP43121 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCAMP43121 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCAMP43121 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCAMP43121 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCAMP43121 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCAMP43121 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCAMP43121 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MCAMP43121 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MCAMP43121 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCAMP43121 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCAMP43121 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCAMP43121 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCAMP43121 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCAMP43121 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCAMP43121 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms