Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms