Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms