Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
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