Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
POLD1P28340 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLD1P28340 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLD1P28340 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLD1P28340 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLD1P28340 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLD1P28340 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLD1P28340 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLD1P28340 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLD1P28340 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLD1P28340 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLD1P28340 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLD1P28340 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLD1P28340 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLD1P28340 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLD1P28340 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLD1P28340 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLD1P28340 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLD1P28340 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLD1P28340 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLD1P28340 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLD1P28340 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLD1P28340 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLD1P28340 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLD1P28340 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLD1P28340 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLD1P28340 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLD1P28340 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLD1P28340 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLD1P28340 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLD1P28340 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLD1P28340 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLD1P28340 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLD1P28340 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLD1P28340 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
POLD1P28340 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLD1P28340 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLD1P28340 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLD1P28340 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLD1P28340 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLD1P28340 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLD1P28340 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLD1P28340 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLD1P28340 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLD1P28340 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLD1P28340 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLD1P28340 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLD1P28340 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLD1P28340 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
POLD1P28340 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLD1P28340 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLD1P28340 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLD1P28340 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLD1P28340 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLD1P28340 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLD1P28340 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLD1P28340 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLD1P28340 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLD1P28340 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLD1P28340 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLD1P28340 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLD1P28340 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLD1P28340 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
POLD1P28340 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLD1P28340 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLD1P28340 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLD1P28340 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLD1P28340 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLD1P28340 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLD1P28340 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLD1P28340 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLD1P28340 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLD1P28340 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLD1P28340 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLD1P28340 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLD1P28340 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
POLD1P28340 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLD1P28340 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLD1P28340 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLD1P28340 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLD1P28340 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLD1P28340 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLD1P28340 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLD1P28340 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLD1P28340 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POLD1P28340 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLD1P28340 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLD1P28340 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POLD1P28340 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLD1P28340 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLD1P28340 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLD1P28340 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLD1P28340 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLD1P28340 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLD1P28340 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLD1P28340 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLD1P28340 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLD1P28340 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLD1P28340 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLD1P28340 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms