Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms