Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRZ1P23471 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRZ1P23471 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms