Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD33P20138 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD33P20138 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD33P20138 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD33P20138 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD33P20138 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD33P20138 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD33P20138 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD33P20138 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD33P20138 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD33P20138 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD33P20138 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD33P20138 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD33P20138 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD33P20138 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD33P20138 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD33P20138 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD33P20138 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD33P20138 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD33P20138 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD33P20138 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD33P20138 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD33P20138 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD33P20138 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD33P20138 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD33P20138 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD33P20138 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD33P20138 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD33P20138 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD33P20138 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD33P20138 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD33P20138 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD33P20138 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD33P20138 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD33P20138 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD33P20138 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD33P20138 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD33P20138 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD33P20138 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD33P20138 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD33P20138 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD33P20138 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD33P20138 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD33P20138 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD33P20138 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD33P20138 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD33P20138 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD33P20138 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD33P20138 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD33P20138 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD33P20138 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD33P20138 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD33P20138 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD33P20138 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD33P20138 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD33P20138 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD33P20138 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD33P20138 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD33P20138 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD33P20138 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD33P20138 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD33P20138 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD33P20138 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD33P20138 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD33P20138 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD33P20138 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD33P20138 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD33P20138 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD33P20138 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD33P20138 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD33P20138 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD33P20138 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD33P20138 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD33P20138 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD33P20138 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD33P20138 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD33P20138 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD33P20138 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD33P20138 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD33P20138 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms