Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms