Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-EP13747 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms