Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRP12270 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRP12270 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRP12270 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRP12270 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRP12270 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRP12270 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRP12270 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRP12270 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRP12270 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRP12270 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRP12270 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRP12270 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRP12270 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRP12270 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TPRP12270 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TPRP12270 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TPRP12270 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TPRP12270 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TPRP12270 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TPRP12270 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TPRP12270 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPRP12270 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPRP12270 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPRP12270 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPRP12270 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPRP12270 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TPRP12270 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPRP12270 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPRP12270 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPRP12270 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPRP12270 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPRP12270 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPRP12270 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPRP12270 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPRP12270 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRP12270 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRP12270 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRP12270 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRP12270 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRP12270 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRP12270 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRP12270 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRP12270 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRP12270 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRP12270 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRP12270 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRP12270 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRP12270 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRP12270 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRP12270 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRP12270 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRP12270 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRP12270 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRP12270 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRP12270 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRP12270 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRP12270 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPRP12270 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPRP12270 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPRP12270 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TPRP12270 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TPRP12270 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPRP12270 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPRP12270 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPRP12270 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPRP12270 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPRP12270 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPRP12270 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPRP12270 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TPRP12270 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPRP12270 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TPRP12270 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPRP12270 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPRP12270 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPRP12270 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPRP12270 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPRP12270 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TPRP12270 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPRP12270 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPRP12270 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPRP12270 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPRP12270 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPRP12270 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPRP12270 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPRP12270 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPRP12270 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPRP12270 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPRP12270 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPRP12270 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPRP12270 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPRP12270 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPRP12270 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPRP12270 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPRP12270 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPRP12270 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPRP12270 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPRP12270 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPRP12270 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPRP12270 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms