Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms