Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms