Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC7A4O43246 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC7A4O43246 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms