Protein–RNA interactions for Protein: O00463

TRAF5, TNF receptor-associated factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5O00463 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF5O00463 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms