Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms