Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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SP6Q3SY56 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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