Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms