Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms