Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms