Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms