Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 ADAMTS9-AS2-202ENST00000474768 2388 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 CHRM5-202ENST00000557872 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 GLRXP3-201ENST00000470810 321 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 MAMDC2-AS1-202ENST00000414515 2097 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 C8orf34-208ENST00000523686 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RPL24P7-201ENST00000399435 453 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RBM11-201ENST00000400577 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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