Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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