Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RALBP1-206ENST00000609094 3676 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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