Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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PKHD1P08F94 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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PKHD1P08F94 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
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PKHD1P08F94 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
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PKHD1P08F94 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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PKHD1P08F94 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
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PKHD1P08F94 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
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PKHD1P08F94 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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PKHD1P08F94 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
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PKHD1P08F94 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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