Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 BDNF-206ENST00000395983 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 NEK1-208ENST00000512193 4430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 AC009166.2-201ENST00000624410 2833 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 EFTUD2-220ENST00000591382 3675 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 IGLV3-12-201ENST00000390313 356 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 GSTA6P-201ENST00000424144 582 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 MIR4437-201ENST00000581331 60 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 KIF15-201ENST00000326047 4842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 ZNF415-214ENST00000597748 2461 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PCDH10Q9P2E7 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 NAPEPLD-209ENST00000465647 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 SCML1-203ENST00000380045 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 LINC01427-202ENST00000635258 4566 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 PALM2-AKAP2-201ENST00000302798 4718 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 MSN-201ENST00000360270 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 SMIM2-201ENST00000400419 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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PCDH10Q9P2E7 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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PCDH10Q9P2E7 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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PCDH10Q9P2E7 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 IGLVI-42-201ENST00000522485 381 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 LINC01974-201ENST00000575126 494 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 OPALIN-203ENST00000393871 3545 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 HKR1-223ENST00000591471 3472 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PCDH10Q9P2E7 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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