Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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