Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.8 ms