Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.4 ms