Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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