Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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