Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
RAB39AQ14964 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms