Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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