Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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DDX39BQ13838 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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DDX39BQ13838 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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DDX39BQ13838 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
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DDX39BQ13838 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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DDX39BQ13838 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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DDX39BQ13838 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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