Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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CLN3Q13286 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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CLN3Q13286 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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CLN3Q13286 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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