Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLFN5Q08AF3 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms