Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TTPAP49638 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TTPAP49638 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TTPAP49638 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TTPAP49638 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TTPAP49638 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TTPAP49638 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TTPAP49638 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TTPAP49638 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TTPAP49638 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TTPAP49638 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TTPAP49638 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TTPAP49638 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TTPAP49638 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TTPAP49638 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TTPAP49638 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TTPAP49638 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TTPAP49638 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TTPAP49638 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TTPAP49638 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TTPAP49638 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TTPAP49638 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TTPAP49638 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TTPAP49638 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TTPAP49638 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TTPAP49638 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TTPAP49638 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TTPAP49638 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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TTPAP49638 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TTPAP49638 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
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TTPAP49638 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TTPAP49638 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TTPAP49638 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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TTPAP49638 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TTPAP49638 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TTPAP49638 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TTPAP49638 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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