Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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