Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
CSRNP3Q8WYN3 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.5 ms