Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 DHRS9-202ENST00000412271 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP45-201ENST00000363509 304 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RGS8-203ENST00000367557 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 OR13D3P-201ENST00000412501 937 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 WRBP1-201ENST00000423352 334 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 IMP3P1-201ENST00000427532 557 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC105942.1-202ENST00000438509 952 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 PRELID1P3-201ENST00000450055 643 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AP003774.3-201ENST00000457725 985 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 MED27-204ENST00000474263 762 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 SNRPCP8-201ENST00000514820 211 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC100823.2-201ENST00000518337 699 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RPL10P9-201ENST00000522551 645 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 ZNF503-AS1-205ENST00000530606 549 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC091304.5-201ENST00000568969 158 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RN7SL697P-201ENST00000582484 299 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 FRG1HP-203ENST00000615326 593 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 NR1I3-235ENST00000628566 1201 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC073488.5-201ENST00000631993 754 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 KLF8-206ENST00000640927 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 BANF2-201ENST00000246090 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 OSCP1-202ENST00000354267 767 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 HEATR5A-201ENST00000382464 507 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 MIR106B-201ENST00000385301 82 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.2 ms